肛门疼痛的原因是由于肛门皮肤神经丰富，感觉敏锐，受刺激后易发生疼痛或剧痛，肛门疼痛给患者带来较大痛苦。引起肛门疼痛的原因很多，肛门疼痛的原因可归纳为下列几个方面：

炎症性病变：多见，包括肛门周围炎及肛周脓疡。初期为灼痛，化脓时可有跳痛如鸡啄，常伴有局部皮肤红肿现象。

肛裂：肛管皮肤溃疡。往往为排便时及排便　后肛门持续　的剧烈疼痛，可伴有少量鲜血。

外痔血栓形成：疼痛多在肛门一侧或两侧，疼痛突发，剧痛如锥，行走、坐蹲更甚，伴有肛门肿物与结节。

肿瘤：由于肿瘤的浸润、压迫及放射治疗后综合征等均可产生疼痛，为坠痛或抽掣状痛，伴有肿瘤结节。

内痔脱垂或直肠脱垂发生嵌顿：此时由于组织水肿，影响貘周循环，产生疼痛甚至组织坏死等。

病毒感染：病毒感染引起的肛周单纯疱疹以及肛门直肠部位的性病。包括梅毒、肛门直肠淋病等。

创伤：当然肛门部位的各类创伤，包括肛门会阴部手术后均可引起疼痛。另外还有少数原因不明的疼痛。

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